Un projet qui illustre bien la force du modèle d'équipe-projet Inria, partenarial, levier d'interdisciplinarité et propice à l'innovation, que ce soit par la création ou le partenariat avec une start-up technologique.

L’équipe MONC (Inria Bx CNRS 🌍 Bordeaux INP) et SOPHiA GENETICS, permettront, grâce à de nouveaux modèles mathématiques et au #MachineLearning, de mieux appréhender le suivi patients et de définir les stratégies thérapeutiques les + adaptées. via Inria bit.ly/2TwYohW

Next it's Sébastien Benzekry presenting Machine learning versus mechanistic modeling for prediction of metastatic relapse in breast cancer #mathonc19

Next up is Sébastien Benzekry to tell us about combining machine learning and mechanistic modeling to predict metastatic relapse in breast cancer #mathonc19

A midi ce mercredi 15.05, rdv à l'amphithéâtre de l'Institut de mathématiques de Université de Bordeaux A33 pour le cycle de sémainaire de l'#oncosphère avec Andreas Bikfalvi et V.Vendrely. Retransmission en direct sur rendez-vous.renater.fr/oncosphere

We’re hiring! Two post-doc positions - on modeling and AI against glioma - are already available and more to come in INRIA Monc Team at Centre Inria de l’université de Bordeaux jobs.inria.fr/public/classic… jobs.inria.fr/public/classic…

Postdoc position available in my group about mathematical modeling of the biology of metastasis in kidney cancer from functional, imaging and genomics data. Please contact me if interested: jobs.inria.fr/public/classic…

A message to all our #bordeaux #cancer scientists who are not on Twitter... so won't read this tweet... 😕 Université de Bordeaux @BERGONIE33 CHU de Bordeaux Inserm CNRS Aquitaine @inserm_u1035 ImmunoConcept

New preprint using an integrative approach to identify molecular determinants of metastasis in kidney cancer. Used lots of -omics analysis and #mathonco modeling of MRI data. Huge work led by Andreas Bikfalvi. INRIA Monc Team disq.us/t/3lak9r2

📣#Écolgie et #Numérique : comprendre et agir ! Conférence-débat le 28/01 à 18h30, Bât A22 amphi Wegener, campus Peixotto. ACollin, JChabassier Centre Inria de l’université de Bordeaux Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA) Université de Bordeaux Bordeaux INP #ecoinfo

Last publication "Machine Learning and Mechanistic Modeling for Prediction of Metastatic Relapse in Early-Stage Breast Cancer" #MachineLearning #mathonco Collab Centre Inria de l’université de Bordeaux INRIA Monc Team SISTM @BERGONIE33 ascopubs.org/doi/10.1200/CC…

We used a mechanistic model for time-to-recurrence based on two biological processes: growth and dissemination

Leveraging a database with 21 clinicopathologic variables in 642 patients with no adjuvant treatment, we used random survival forest algorithms to select the set of most informative features (Ki67, tumor size, age, EGFR and CD44)

The mechanistic model was able to accurately fit the time-to-event data, using mixed-effects learning for inter-individual variability

For prediction, the mechanistic model revealed as good (if not better) than classical machine learning algorithms and Cox regression. Importantly, the MM could inform on the biological meaning of covariates (i.e. Ki67 on growth, EGFR on dissemination)

Finally, the mechanistic model provides a way to give individual simulations and predictions about the invisible metastatic state at diagnosis

Open postdoc position under my supervision for quantitative modeling of response to #immunotherapy in lung cancer using a large data set with high-dimensional, longitudinal data from the #PIONeeR clinical study. jobs.inria.fr/public/classic…

[En tête-à-tête avec] Olivier Saut, un #mathématicien qui travaille sur le #cancer ! Directeur de recherche au CNRS 🌍 et Responsable de l'équipe INRIA Monc Team, il travaille sur la modélisation et l’IA en #oncologie pour aider à la prise en charge des #cancers. bit.ly/3rfCcve