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大学院までくると「頭が良いこと」の定義はますます素朴になります。 ① 自分にあるもので考える ② 疑問を分割し、考えたり寝かせたりする ③ 困ったら人を頼る 大学院では問題意識が評価され、『常人なら考えるのをやめてしまう』そんな問題に取り組みます。知識は道具ですが、興味は実力です。

こちらも今からです！老化に興味ある人は必見の結果がプレゼンされます　 #MBSJ2024

12月2日（月）10時から北海道大学農学部S21講義室で「ヒドラ（Hydra vulgaris）のトランスポゾンがもたらすゲノム動態とその進化的意義」についてお話をさせて頂きます。

Thank you all! Very happy that I can continue to work in such a collaborative environment Max Perutz Labs Vienna Vienna BioCenter Thank you for all the support!

2/28遺伝研にて、川上浩一先生（発生遺伝学研究室）の最終講演が行われました。「A quest with fish and a transposon: from functional genomics to neuroscience」と題し、ゆかりある皆様をはじめ、多くの方に会場とオンラインでご参加いただきました。

新たなヒト疾患モデル魚として、ドクターフィッシュ（学術名ガラルファ）を提案するレビュー論文がpublishされました ゼブラフィッシュ等の熱帯魚より高温（37度）で飼育可能であり、繁殖が容易です 現在、３カ国間共同研究を行っており、その内容についても紹介しています zoologicalletters.biomedcentral.com/articles/10.11…

ドクターフィッシュのモデル動物としての将来性について議論した総説論文が出版されました。ウィーン大学・三重大学・BRIN（インドネシア）・アクデニズ大学（トルコ）との国際研究となります。異分野融合で活発な議論ができる創造的なプロジェクトに参加させて頂いており、関係者の皆様に感謝です。

Our review on the potential of doctor fish as a model organism is out! Grateful for this international collaboration with Uni Vienna, Mie Univ, BRIN (Indonesia), and Akdeniz (Turkey), fostering cross-disciplinary discussions! Yasuhito SHIMADA (島田康人) Koto Kon-Nanjo, MD zoologicalletters.biomedcentral.com/articles/10.11…

Our preprint on the genome assembly of Doctor Fish (G. rufa)! G. rufa thrives above 37°C, making it a great model for cancer xenografts & infectious diseases. The assembly is a key resource for its development as a disease model. biorxiv.org/content/10.110… Yasuhito SHIMADA (島田康人) Koto Kon-Nanjo, MD

ドクターフィッシュ(G. rufa)のゲノム解読のプレプリントが公開です!G.rufaはコイ科でゼブラフィッシュとゲノム構造が似てますが、37℃で生存可能で、がん異種移植モデルや感染症モデルとして有望です。構築した参照ゲノム配列は、今後の研究展開の基盤となります。biorxiv.org/content/10.110… Yasuhito SHIMADA (島田康人)

Chromosome-level genome assembly of the doctor fish (Garra rufa) biorxiv.org/content/10.110… #biorxiv_genomic

📣2025年度先進ゲノム支援公募要項を公開しました。 genome-sci.jp/whatsnew/news/… 次世代シーケンサーやシングルセル解析装置、空間オミックス解析装置を駆使した多様な技術による支援が、【原則、解析費用自己負担なし】で受けられます。 データの情報解析も支援可能です。

Our paper titled "Subtelomeric repeat expansion in Hydractinia symbiolongicarpus chromosomes" has been published in Mobile DNA! Subtelomeric accumulation of Helitron-like elements in Hydractinia suggests its potential role in chromosome evolution. link.springer.com/article/10.118…

成体多能性幹細胞を持つHydractiniaのゲノム論文(Kon-Nanjo, et al., 2023)のフォローアップ論文が出版されました。Helitron様の繰り返し配列がHydractiniaゲノムのサブテロメア領域に高度に蓄積していることを見出しました。link.springer.com/article/10.118…

biorxiv.org/content/10.110… A co-author preprint on the Nanomia septata genome has been released from Dunn's lab in Yale Univ. N. septata has expanded genome with only 8 chromosomes. This is a very interesting case in chromosomal evolution of Cnidaria.

ついに、高温耐性をもつ小型魚類「ドクターフィッシュ」のゲノム解読論文を Scientific Data に発表しました！ 高温耐性の分子機構の解明に加え、37℃環境でのヒト癌移植モデルの構築など、さまざまな応用展開が期待されます。三重大学Yasuhito SHIMADA (島田康人)、BRINとの国際共同研究です。nature.com/articles/s4159….

Finally, our genome paper on the heat-tolerant “doctor fish” is out in Scientific Data! It paves the way for studying heat tolerance and developing human cancer xenograft models at 37°C for drug screening! Worked with Mie Uni (Japan) and BRIN (Indonesia). nature.com/articles/s4159…

『実験医学羊土社 実験医学』6月号に留学体験記を寄稿しました。基礎医学・比較ゲノミクス研究選んだ理由、ウィーン大学の研究生活、そして将来の展望まで、自身の歩みを振り返りながら綴っています。研究留学やキャリアの一例としてご参考になれば幸いです。皆様に感謝致します。yodosha.co.jp/jikkenigaku/ar…

I published a short essay in Experimental Medicine about my overseas research experience. I reflect on why I chose comparative genomics, my time at the University of Vienna, and thoughts on what's next. Thanks to everyone who supported me. yodosha.co.jp/jikkenigaku/ar…

三重大学、BRIN、ウィーン大学との国際共同研究で構築したドクターフィッシュの全ゲノム配列が新聞で取り上げられました。