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Estimating gene-level false discovery probability improves eQTL statistical fine-mapping precision dlvr.it/SyHZzk

Poster presentation by Yugo Takahashi (medical student) & Qingbo Seiha Wang got "Reviewers' choice abstract" in ASHG meeting 2023㊗️🎉 Japan Omics Browser (JOB), integrative visualization of multi-omics data of Japanese. Publickly available at japan-omics.jp #ASHG2023 #eqtl #pqtl

New application of knockoff genotypes (synthetic genotypes resembling original ones) for omics resources by Qingbo Seiha Wang. Knockoff–Finemap combination (KFc), a refined fine-mapping algorithm of eQTL to adjust PIPs. Now at NAR Genom Bioinform🎉㊗️ academic.oup.com/nargab/article…

gnomADのデータを利用して、非コード領域での選択圧の有無を検討した論文。Qingbo Seiha Wangさんも著者に加わっている。Nature。 nature.com/articles/s4158…

東大/阪大時代の仕事が形になりました - 血漿タンパク質発現量に影響するゲノム変異(=pQTL)を網羅的に同定し、血液内mRNA発現量やその他機能の比較を通じて、メカニズムや疾患との関連を考察しました。指導をして下さった岡田随象教授をはじめ、研究に貢献された皆様に感謝いたします。

【注目プレスリリース】「コロナ制圧タスクフォース」 血漿タンパク質量の個人差に寄与するヒトゲノム配列を大規模に同定 / 東京大学,大阪大学,理化学研究所,慶應義塾大学,科学技術振興機構 research-er.jp/articles/view/…

Plasma protein QTL (pQTL) & eQTL analysis of 1,400 Japanese lead by Qingbo Seiha Wang 南宮湖(Ho Namkoong) , supported by Japan COVID-19 Task Force (JCTF), is published Nature Genetics 🎉㊗️ Functional fine-mapping by MPRA prioritized variants linked to GWAS &💊. #pQTL #eQTL nature.com/articles/s4158…

📢Online now! 📰Allele frequency impacts the cross-ancestry portability of gene expression prediction in lymphoblastoid cell lines 🧑‍🤝‍🧑marie.saitou Xuanyao Liu & co cell.com/ajhg/abstract/…